El 21 de julio de 1899 Viedma fue arrasada por la más importante inundación de la que se tenga registro en la zona. Las aguas del río Negro ingresaron desde el sur y llegaron a una altura superior a los cuatro metros en algunos sectores. La mayoría de los edificios de la ciudad que ya tenía 120 años de historia colapsaron por el fenómeno.
Como consecuencia del evento natural Viedma perdió su condición de Capital del Territorio Nacional de Rio Negro y su reconstrucción a primera vista parecía imposible. Sin embargo, los viedmenses apelaron a la resiliencia y no bajaron sus brazos. Reconstruyeron ladrillo por ladrillo cada casa, cada hogar que la gran inundación les había arrebatado. Lucharon para recuperar la Capital que había comenzado a funcionar en Choele Choel y lograron construir la defensa a lo largo del río para protegerse de nuevos embates del majestuoso Currú Leuvú.
Diez años después de ese episodio que marcó parte de la historia local, se inauguró el actual edificio Municipal y más tarde la primera Escuela Normal Mixta de la Patagonia.